(Feature AtomMatching,FAM)算法模型,通过将配体与靶蛋白 CIM 的求解速度比经典算法快至少三个数量级,该算法显著提升 的对接问题转换为配体原子和对接格点的匹配问题,并添加位置 了对接效率,有望实现高精度的超高通量筛选。 约束和配体空间形状约束,构建得到以下伊辛模型: 其中,Waua;为原子a;放置在格点d;上的适配度,Kaist、Kmono、Cdist为模型 三个可调参数。通过CIM求解上述伊辛模型可得到配体对接构象。 示,GPM与商业化软件具有相当的采样能力,但在速度上,基于